Satz von Genen prognostiziert schwere dengue -, Studien-Berichte

Es gibt keine solche Sache wie eine „gute“ Fall von dengue-Fieber, aber einige sind schlimmer als andere, und es ist schwierig zu bestimmen, welche Patienten einen reibungslosen Erholung und die finden Ihren Zustand lebensbedrohlich.

Jetzt, nach dem reinigen der gen-expression von Hunderten von infizierten Patienten mit dengue-virus—ein mosquito-borne virus kann zu Fieber und Gelenkschmerzen, unter anderen Symptome—Wissenschaftler an der Stanford University School of Medicine haben festgestellt, eine Reihe von 20 Genen, die vorhersagt, wer das höchste Risiko des Fortschreitens zu einer schweren form der Krankheit.

Jedes Jahr werden zwischen 200 Millionen und 400 Millionen Menschen in tropischen und subtropischen Regionen der Welt-Vertrag von dengue-Fieber, etwa 500.000 dieser Fälle enden tödlich. Für die meisten Leute mit der Krankheit erholen nach Erhalt der Fluide und ein paar Tagen Erholung, sagte Purvesh Khatri, Ph. D., außerordentlicher professor von Medizin und von biomedizinischer Daten Wissenschaft. „Es gibt aber eine kleinere Untergruppe von Patienten, die schwere dengue-Fieber, und jetzt wissen wir nicht, wie zu sagen, der Unterschied.“

Überall von 5 bis 20 Prozent der dengue-Fälle Voraus, die zu schweren. Derzeit ist der standard der Pflege spitzt sich zu, beobachten und warten: Zur diagnose schwere dengue-Fieber, die ärzte warten, um zu beobachten, bestimmte Symptome und die Ergebnisse der Laboruntersuchungen, die in der Regel entstehen in den späten Stadien der Krankheit. „Diese Praktiken sind nicht annähernd sensible oder genau genug, und einige Patienten am Ende der Aufnahme in das Krankenhaus unnötig, während andere vorzeitig entlassen,“ sagte Shirit Einav, MD, außerordentlicher professor von Medizin und von Mikrobiologie und Immunologie.

Mit Ihrer neu entdeckten Gene als Grundlage, Sind und Khatri Zielen auf die Identifizierung von prädiktiven Biomarkern, die helfen können ärzte zuverlässig abschätzen der Wahrscheinlichkeit von schweren dengue-Fieber in Patienten, die neu symptomatische und diese Informationen verwenden, um genauere Pflege, um zu helfen, therapeutische klinische Studien und in die Zukunft zu leiten, die Behandlung Entscheidungen.

Ein Papier detailliert die Ergebnisse der Studie werden veröffentlicht, Jan. 29 in Cell Reports. Einav und Khatri sind co-senior-Autoren. Postdoc-Stipendiat Makeda Robinson, Ph. D., und ehemaliger wissenschaftlicher Mitarbeiter Timotheus Sweeny, MD, Ph. D., Aktie führen Urheberschaft.

Bergbau-alte Daten

Adept bei der Detektivarbeit, neue Erkenntnisse aus alten Daten, Khatri fünf bisher veröffentlichten arbeiten, die berichteten Informationen auf über 450 Personen Kollektiv zu identifizieren, die schweren dengue-gen gesetzt. Jede Studie katalogisiert Gruppen von dengue-Patienten, tracking das „Transkriptom“, oder Datensatz, der Genexpression, beim auftreten der Symptome für jeden Fall.

„Die Papiere waren Daten auf dengue-Patienten aus mehreren Ländern. Wir schauten uns die Daten an und fragte, ‚Unabhängig von der Patienten, genetischer hintergrund, Alter und die Genetik des dengue-virus selbst—unterschiedliche Regionen haben unterschiedliche Formen von dengue—was ist die molekulare Reaktion, die immer zeigt, wenn Sie haben eine dengue-Infektion?'“ Khatri sagte. „Aber wir waren nicht im Vergleich gesund versus-infizierten Patienten; wir verglichen diejenigen, die einen unkomplizierten dengue-Infektion mit denen, die entwickelt schwere dengue-Fieber.“

In die Analyse von Daten aus fünf Studien, Khatri und Sind 20 Gene identifiziert, die herausragten. In allen der Patienten entwickelt schwere dengue-Fieber, diese Gene zeigten eine spezifische expression Muster oder Signatur: Siebzehn wurden underexpressed, während die drei waren überaktiv. Aber die Vorhersage von schweren dengue-ist komplexer als die Frage, ob Patienten, die Ausdruck dieser Muster; es gibt Variabilität. Einige der Gene waren unten-geregelt in einem größeren Ausmaß bei einigen Patienten, und weniger in anderen; ebenso war die Variabilität im Grad der Absonderung, in der Gene überexprimiert.

„Diese Vorhersage-Methode ist eher ein Kontinuum als eine binäre“ Khatri sagte. Sinn des Kontinuums, die Forscher entwickelten ein score-Anteil für dieses gen-expression Variabilität, die im wesentlichen die Bewertung der Patienten Risiko für schwere dengue-basierend auf dips und weckt der Ausdruck in diesen 20 Genen. Je höher die Punktzahl, desto höher ist die Gefahr des schweren dengue-Fieber.

Dann erprobten Sie Ihre dengue-Vorhersage-Methode auf Daten aus drei separaten, zuvor veröffentlichte Kohorten von dengue-Patienten, deren Transkriptom-Daten war öffentlich und fand, dass die 20-gen vorhergesagte 100 Prozent der Patienten entwickelt schwere dengue-Fieber. Unter denen, die vorausgesagt unten mit schweren dengue -, 78 Prozent waren.

Die Prüfung der test

Als Nächstes wollten die Forscher sehen, wenn Ihre vorausschauende Maßnahme gelingen würde, in einer realen Patientenpopulation. So in Zusammenarbeit mit dem Clinical Research Center des Valle del Lili-Stiftung in Kolumbien, die Sie einrichten einer prospektiven Kohorte von 34 Teilnehmern mit dengue-Beurteilung der Wirksamkeit der prädiktiven gen-Marker. Jeder Teilnehmer Transkriptom Informationen, die kam aus einer einfachen Blutprobe, ergab einen prädiktiven score basiert auf der 20-gen gesetzt, und wieder, Einav und Khatri sah das gleiche Maß an Genauigkeit in Ihrem test: Der test vorausgesagt, dass die Teilnehmer mit schwerem dengue-Fieber, und es gab nur wenige Patienten vorausgesagt, um sich zu entwickeln schwere dengue wer nicht.

„Natürlich, diese Bevölkerung samples sind klein, und wir wollen, um unsere Ergebnisse zu bestätigen, die in größeren Kohorten,“ Khatri sagte. Die Forscher planen, durchführen größeren Studien, wie Sie zum Ziel zu bringen, ist die Bewertung in die klinische Anwendung. Sie sind bereits erweitert Studien in Paraguay.

„Mit einer größeren Kohorte, es ist auch eine Gelegenheit zur Verfeinerung der Signatur; wir könnten potenziell senken die Anzahl der Gene,“ Einav sagte. „Es gibt keine perfekte Prüfung, aber wir sind ermutigt von diesen zahlen, und das ist schon besser als der aktuelle standard der Versorgung.“

Es ist ebenfalls möglich, dass die Gene dienen könnte als Grundlage für eine gezielte Therapie für dengue-Fieber, Einav gesagt—aber das ist weit am Horizont. Jetzt sind die Forscher beginnen zu verfolgen, die Mechanismen, die hinter diesen 20 Genen, die versuchen zu verstehen, warum Sie scheinen, um vorauszusagen, das Schicksal des dengue-Patienten.