Überwachung RNA-hotspots verrät Ziel in der Krebs-tumor-Zellen
Eine neue University of California, Irvine-geführte Studie zeigt, ein protein verantwortlich für die genetischen Veränderungen, die sich in einer Vielzahl von Krebsarten, möglicherweise auch der Schlüssel zu mehr effektive, zielgerichtete Krebstherapie.
Die Studie, heute veröffentlicht in Nature Communications, mit dem Titel „Quantifizierung des Laufenden APOBEC3A-Aktivität in tumor-Zellen durch die überwachung der RNA-editing an hotspots,“ zeigt, wie die genomische Instabilität induziert durch die protein APOBEC3A bietet eine bisher unbekannte Schwachstelle in der Krebs-Zellen.
Jeden Tag, in menschlichen Zellen, Zehntausende von DNA-Schäden Ereignisse auftreten. In der Krebs-Zellen, die expression des proteins APOBEC3A ist eine der häufigsten Quellen von DNA-Schäden und Mutationen. Während die Mutationen, die durch diese bestimmten Proteine in der Krebs-Zellen beitragen zur tumor-Entwicklung, die Sie auch verursachen Brüche in der DNA, die eine Schwachstelle.
„Auf Krebs-Zellen mit hoher APOBEC3A protein-Aktivitäten und stören, zur gleichen Zeit, die DNA-Schadens-Antwort notwendig zu reparieren Schäden, die durch APOBEC3A, könnte der Schlüssel zu effektiver Krebs-Therapien“, sagte Remi Buisson, Ph. D., senior investigator und assistant professor in der Abteilung für Biologische Chemie an der UCI School of Medicine. „Allerdings, um die Sicherheitsanfälligkeit ausnutzen, die von den Krebszellen, ist es kritisch, einen ersten quantitativen Messung der protein-s-Aktivität in Tumoren.“
Zum Verständnis der Rolle der APOBEC3A in der tumor-Entwicklung und Ziel der APOBEC3A -bedingte Schwachstellen, die Forscher entwickelten einen assay zum Messen der RNA-editing-Aktivität von APOBEC3A in Krebs Zellen. Da APOBEC3A ist schwer zu quantifizieren sind, in Tumoren, die Entwicklung einer hoch sensitiven assay zum Messen der Aktivität kritisch war. Mit hotspot-RNA-Mutationen identifiziert, die von APOBEC3A-positiven Tumoren, entwickelte das team ein assay mit Tröpfchen-digital PCR und demonstriert seine Anwendung an klinischen Proben von Patienten mit Krebs.