Modell sagt Voraus, Fledermaus-Arten, die das Potenzial zur Verbreitung tödliche Nipah-virus in Indien

Seit seiner Entdeckung im Jahre 1999, Nipah-virus ist berichtet worden, fast jährlich in Südost-Asien, Bangladesch und Indien zu den am härtesten getroffen. In einer neuen Studie, die heute veröffentlicht in PLoS Vernachlässigte Tropenkrankheiten, Wissenschaftler verwendeten maschinellen Lernens um zu identifizieren, Fledermaus-Arten, die das Potenzial host Nipah-virus, mit einem Schwerpunkt auf Indien, die die Website von einem Jahr 2018 Ausbruch. Vier neue Fledermaus-Arten, die gekennzeichnet wurden als überwachungs-Prioritäten.

Barbara Han, eine Krankheit, ökologe am Cary-Institut von Ökosystem-Studien, ist ein co-lead-Autor auf dem Papier. Sie erklärt, „, Während es wächst die Einsicht, dass Fledermäuse eine Rolle bei der übertragung der Nipah-virus in Südostasien, weniger ist bekannt über die Arten stellen die meisten Risiko. Unser Ziel war es, zu helfen, festzulegen, weitere Arten mit hoher Wahrscheinlichkeit der Durchführung Nipah -, Ziel-überwachung und Schutz der öffentlichen Gesundheit.“

Raina K. Plowright, eine Krankheit, ökologe an der Montana State Universität, war auch ein co-lead Autor. Sie stellt fest, „das Papier wurde zu drücken, ein weiterer Fall von Nipah-virus bestätigt wurde, in Kerala. Die öffentliche Gesundheit Gemeinschaft hat wieder gezwungen worden, in den reaktiven Modus. Unsere Studie ist ein Ausgangspunkt für die Forschung benötigt, zu enthalten Nipah an der Quelle, also sind wir verwalten spillover-risk, anstatt das Leid der Menschen.“

Nipah-virus ist eine hoch letale, aufstrebenden henipavirus, die übertragen werden können, um Menschen aus den Körperflüssigkeiten von infizierten Fledermäusen. Essen Obst oder trinken date palm sap, die kontaminiert worden durch Fledermäuse markiert wurde, als die übertragung Weg. Einmal infiziert, können die Leute verbreiten das virus direkt zu anderen Menschen, Funkenbildung einen Ausbruch. Hausschweine sind auch bridging-hosts, die Menschen infizieren können. Es gibt keinen Impfstoff und das virus hat eine hohe Sterblichkeit.

„Fledermaus-Viren sind auf der ganzen Welt gefunden, aber die überwachung und Probenahme wurden die Anstrengungen lückenhaft“, sagt Han. „Wahrscheinlich gibt es viele kompetente Nipah-hosts, die noch nicht identifiziert worden. Aus diesem Grund ist es erforderlich, neue Methoden entwickeln, nehmen alle verfügbaren Daten in Betracht zu leiten sampling-Bemühungen in Indien und in anderen Regionen.“

Indien ist die Heimat von schätzungsweise 113 Fledermaus-Arten. Nur 31 dieser Arten wurden aufgenommen Nipah-virus, mit 11 gefunden, um Antikörper, die das signal host-Potenzial. Plowright stellt fest: „Angesichts der Rolle, die Fledermäuse spielen bei der übertragung von Viren, die Infektionskrankheiten auf den Menschen, die Investition in das Verständnis dieser Tiere ist gering. Die Letzte umfassende und systematische, taxonomische Studie über die Fledermäuse, die in Indien durchgeführt wurde, vor mehr als einem Jahrhundert.“

Maschine gelehnt, eine form von künstlicher Intelligenz, die verwendet wurde, um Flagge Fledermaus-Arten, die das Potenzial Hafen Nipah. Han erklärt, „Durch die Betrachtung der Merkmale von Fledermaus-Arten bekannt, tragen Nipah-Global, unser Modell war in der Lage, Vorhersagen zu machen über weitere Fledermaus-Arten, die Ihren Wohnsitz in Indien, mit dem Potenzial, um das virus in sich tragen und übertragen Sie zu den Menschen. Diese Fledermäuse sind derzeit nicht auf dem öffentlichen radar Gesundheit und würdig weitere Studie.“

Zunächst das team zusammengestellt veröffentlichten Daten auf Fledermaus-Arten bekannt, zu tragen, Nipah-und andere henipaviruses weltweit. Daten enthalten 48 Züge von 523 Fledermaus-Arten, einschließlich der Informationen, die auf Futtersuche Methoden, Ernährung, migration, Verhalten, geographische Bereiche und Reproduktion. Sie sah auch die ökologischen Bedingungen, in denen die berichteten Nebenwirkungen aufgetreten.

Dann wendeten Sie ein Merkmal-basierten machine-learning-Ansatz, um eine Teilmenge von Arten, die auftreten, in Asien, Australien und Oceana. Ihren Algorithmus identifiziert bekannt Nipah-positive Fledermaus-Arten mit 83% Genauigkeit. Es wurde auch festgestellt, sechs Fledermaus-Arten, die auftreten, in Asien, Australien und Oceana, die Züge, die machen könnte Ihnen kompetente hosts und sollte priorisiert werden, für die überwachung. Diese vier Arten kommen in Indien, zwei von denen gefunden in Kerala.

Plowright, erklärt, „Wir machen trait-basierte Vorhersagen von wahrscheinlichen henipavirus Stauseen in Kerala. Unser Fokus war eng, aber das Modell wurde erfolgreich bei der Identifizierung von Nipah-hosts, die belegen, dass dieses Verfahren könnte auch dienen als ein leistungsfähiges Werkzeug in der Führung überwachung für Nipah-und andere Krankheit-Systeme.“

Die Autoren beachten, dass Ihre Vorhersagen werden müssen, kombiniert mit lokalem wissen auf Fledermaus-ökologie—einschließlich der distribution, die fülle und die Nähe zu den Menschen—zu entwerfen, Probenahme Pläne, die effektiv identifizieren bat-hosts, die eine Gefahr für den Menschen. Diese Arbeit liefert eine Liste von Arten zu führen frühe überwachung und sollte nicht als eine endgültige Liste von Talsperren.